集裝箱的用途不同而分有以下幾種:
1．干貨集裝箱（Dry Cargo Container）
　　也稱雜貨集裝箱，這是種通用集裝箱，用以裝載除液體貨、需要調節溫度貨物及特種貨物以外的雜貨。這種集裝箱使用范圍極廣，常用的有20ft和40ft兩種，其結構特點是常為封閉式，通常在后端或側面設有箱門。
2．開頂集裝箱（Open Top Container）
　　也稱敞頂集裝箱，這是種沒有剛性箱頂的集裝箱，但有可折式頂梁支撐的帆布、塑料布或涂塑布制成的頂篷，其它構件與干貨集裝箱類似。開頂集裝箱適于裝載較高的大型貨物和需吊裝的重貨。
3．臺架式及平臺式集裝箱（Platform Based COntainer）
　　臺架式集裝箱是沒有箱頂和側壁，甚至有的連端壁也去掉而只有底板和四個角柱的集裝箱。
　　臺架式集裝箱有很多類型。它們的主要特點是：為了保持其縱向強度，箱底較厚。箱底的強度比普通集裝箱大，而其內部高度則比平常集裝箱低。在下側梁和角柱上設有系環，可把裝載的貨物系緊。臺架式集裝箱沒有水密性，怕水濕的貨物不能裝運，適合裝載形狀不同的貨物。臺架式集裝箱可分為：敞側臺架式、全骨架臺架式、有完整固定端壁的臺架式、無端僅有固定角柱和底板的臺架式集裝箱等。
　　平臺式集裝箱是僅有底板而無上部結構的集裝箱。該集裝箱裝卸作業方便，適于裝載長、重大件。
4．通風集裝箱（Ventilated Container）
　　通風集裝箱通常在側壁或端壁上設有通風孔，適于裝載不需要冷凍而需通風、防止汗濕的貨物，如水果、蔬菜等。如將通風孔關閉，可作為雜貨集裝箱使用。
5．冷藏集裝箱（Reefer Container）
　　這是專為運輸要求保持相當溫度的冷凍貨或低溫貨而設計的集裝箱。它分為帶有冷凍機的內藏式機械冷藏集裝箱和沒有冷凍機的外置式機械冷藏集裝箱。適用裝載肉類、水果等貨物。冷藏集裝箱造價較高，營運費用較高，使用中應注意冷凍裝置的技術狀態及箱內貨物所需的溫度。